Jontahan Gilbert został adoptowany przez aktora, Paula Gilberta; jest bratem aktorek Melissy i Sary Gilbert oraz wnukiem scenarzysty Harry'ego Crane'a.
Otrzymał tytuł licencjata z Hamilton College i magistra z finansów z Zicklin School of Business at Baruch College.
Jest bratem przyrodnim aktorek Sary Gilbert i Claudii Cowan.